Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

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Length 576 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Zfp248Q640N4 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Zfp248Q640N4 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Zfp248Q640N4 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Zfp248Q640N4 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Zfp248Q640N4 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Zfp248Q640N4 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Zfp248Q640N4 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Zfp248Q640N4 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Zfp248Q640N4 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
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Zfp248Q640N4 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Zfp248Q640N4 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Zfp248Q640N4 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Zfp248Q640N4 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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