Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc18Q640L5 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms