Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnot7Q60809 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnot7Q60809 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnot7Q60809 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnot7Q60809 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot7Q60809 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot7Q60809 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot7Q60809 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot7Q60809 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot7Q60809 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot7Q60809 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot7Q60809 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot7Q60809 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot7Q60809 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot7Q60809 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot7Q60809 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Cnot7Q60809 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot7Q60809 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot7Q60809 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot7Q60809 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot7Q60809 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot7Q60809 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot7Q60809 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot7Q60809 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot7Q60809 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot7Q60809 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot7Q60809 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot7Q60809 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot7Q60809 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot7Q60809 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot7Q60809 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot7Q60809 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot7Q60809 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot7Q60809 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot7Q60809 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot7Q60809 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot7Q60809 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Cnot7Q60809 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot7Q60809 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot7Q60809 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Cnot7Q60809 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot7Q60809 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot7Q60809 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot7Q60809 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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Cnot7Q60809 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot7Q60809 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot7Q60809 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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Cnot7Q60809 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot7Q60809 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Cnot7Q60809 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot7Q60809 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot7Q60809 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot7Q60809 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot7Q60809 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot7Q60809 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Cnot7Q60809 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot7Q60809 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot7Q60809 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot7Q60809 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Cnot7Q60809 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot7Q60809 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot7Q60809 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot7Q60809 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot7Q60809 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot7Q60809 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot7Q60809 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot7Q60809 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot7Q60809 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot7Q60809 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot7Q60809 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot7Q60809 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot7Q60809 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot7Q60809 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot7Q60809 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot7Q60809 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot7Q60809 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot7Q60809 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot7Q60809 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot7Q60809 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot7Q60809 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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Cnot7Q60809 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot7Q60809 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot7Q60809 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot7Q60809 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot7Q60809 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms