Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms