Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms