Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MestQ07646 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MestQ07646 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MestQ07646 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MestQ07646 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MestQ07646 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
MestQ07646 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
MestQ07646 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
MestQ07646 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MestQ07646 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MestQ07646 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
MestQ07646 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MestQ07646 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
MestQ07646 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
MestQ07646 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MestQ07646 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
MestQ07646 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MestQ07646 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
MestQ07646 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MestQ07646 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
MestQ07646 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MestQ07646 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MestQ07646 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
MestQ07646 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MestQ07646 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
MestQ07646 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MestQ07646 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MestQ07646 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MestQ07646 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
MestQ07646 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
MestQ07646 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
MestQ07646 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
MestQ07646 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MestQ07646 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
MestQ07646 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MestQ07646 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
MestQ07646 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
MestQ07646 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MestQ07646 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
MestQ07646 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
MestQ07646 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MestQ07646 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MestQ07646 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MestQ07646 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MestQ07646 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MestQ07646 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MestQ07646 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MestQ07646 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MestQ07646 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
MestQ07646 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
MestQ07646 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MestQ07646 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
MestQ07646 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
MestQ07646 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
MestQ07646 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
MestQ07646 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
MestQ07646 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
MestQ07646 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MestQ07646 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MestQ07646 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MestQ07646 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MestQ07646 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MestQ07646 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
MestQ07646 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MestQ07646 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
MestQ07646 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MestQ07646 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MestQ07646 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MestQ07646 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MestQ07646 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MestQ07646 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MestQ07646 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MestQ07646 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MestQ07646 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MestQ07646 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MestQ07646 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MestQ07646 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
MestQ07646 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MestQ07646 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MestQ07646 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MestQ07646 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MestQ07646 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MestQ07646 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MestQ07646 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MestQ07646 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MestQ07646 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MestQ07646 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MestQ07646 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MestQ07646 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MestQ07646 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MestQ07646 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MestQ07646 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MestQ07646 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MestQ07646 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MestQ07646 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MestQ07646 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MestQ07646 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MestQ07646 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MestQ07646 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MestQ07646 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms