Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Col1a2Q01149 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms