Protein–RNA interactions for Protein: P82348

Sgcg, Gamma-sarcoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcgP82348 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgcgP82348 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgcgP82348 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgcgP82348 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgcgP82348 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgcgP82348 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgcgP82348 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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SgcgP82348 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgcgP82348 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgcgP82348 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SgcgP82348 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
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