Protein–RNA interactions for Protein: P59913

Pcmtd1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcmtd1P59913 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pcmtd1P59913 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pcmtd1P59913 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pcmtd1P59913 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pcmtd1P59913 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pcmtd1P59913 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcmtd1P59913 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcmtd1P59913 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcmtd1P59913 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcmtd1P59913 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcmtd1P59913 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcmtd1P59913 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcmtd1P59913 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcmtd1P59913 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcmtd1P59913 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcmtd1P59913 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcmtd1P59913 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcmtd1P59913 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcmtd1P59913 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcmtd1P59913 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcmtd1P59913 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcmtd1P59913 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcmtd1P59913 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcmtd1P59913 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcmtd1P59913 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcmtd1P59913 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcmtd1P59913 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcmtd1P59913 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcmtd1P59913 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcmtd1P59913 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcmtd1P59913 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcmtd1P59913 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcmtd1P59913 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcmtd1P59913 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcmtd1P59913 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcmtd1P59913 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcmtd1P59913 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcmtd1P59913 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcmtd1P59913 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcmtd1P59913 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcmtd1P59913 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcmtd1P59913 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcmtd1P59913 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcmtd1P59913 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcmtd1P59913 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcmtd1P59913 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcmtd1P59913 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcmtd1P59913 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcmtd1P59913 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcmtd1P59913 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcmtd1P59913 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcmtd1P59913 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcmtd1P59913 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcmtd1P59913 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcmtd1P59913 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcmtd1P59913 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcmtd1P59913 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcmtd1P59913 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcmtd1P59913 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcmtd1P59913 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms