Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
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