Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18528 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18528 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18528 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18528 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18528 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18528 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18528 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P18528 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18528 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18528 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P18528 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18528 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P18528 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18528 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18528 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P18528 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P18528 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P18528 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P18528 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18528 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18528 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18528 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18528 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18528 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18528 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18528 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18528 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18528 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18528 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18528 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18528 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18528 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18528 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P18528 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P18528 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P18528 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P18528 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
P18528 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P18528 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P18528 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P18528 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18528 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18528 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18528 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18528 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18528 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P18528 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18528 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18528 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18528 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18528 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18528 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18528 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P18528 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18528 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18528 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18528 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18528 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P18528 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18528 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18528 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18528 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18528 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18528 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18528 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18528 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18528 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18528 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18528 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18528 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18528 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18528 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18528 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18528 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18528 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18528 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18528 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18528 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18528 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18528 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18528 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18528 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18528 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18528 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18528 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18528 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18528 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P18528 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18528 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18528 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18528 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18528 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18528 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18528 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18528 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P18528 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18528 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18528 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18528 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms