Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms