Protein–RNA interactions for Protein: P06801

Me1, NADP-dependent malic enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me1P06801 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Me1P06801 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Me1P06801 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Me1P06801 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Me1P06801 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Me1P06801 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Me1P06801 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Me1P06801 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Me1P06801 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Me1P06801 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Me1P06801 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Me1P06801 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Me1P06801 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Me1P06801 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Me1P06801 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Me1P06801 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Me1P06801 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Me1P06801 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Me1P06801 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Me1P06801 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Me1P06801 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Me1P06801 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Me1P06801 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Me1P06801 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Me1P06801 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Me1P06801 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Me1P06801 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Me1P06801 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Me1P06801 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Me1P06801 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Me1P06801 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Me1P06801 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Me1P06801 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Me1P06801 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Me1P06801 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Me1P06801 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Me1P06801 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Me1P06801 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Me1P06801 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Me1P06801 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Me1P06801 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Me1P06801 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Me1P06801 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Me1P06801 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Me1P06801 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Me1P06801 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Me1P06801 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Me1P06801 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Me1P06801 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Me1P06801 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Me1P06801 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Me1P06801 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Me1P06801 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Me1P06801 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Me1P06801 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Me1P06801 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Me1P06801 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Me1P06801 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Me1P06801 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Me1P06801 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Me1P06801 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Me1P06801 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Me1P06801 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Me1P06801 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Me1P06801 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Me1P06801 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Me1P06801 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Me1P06801 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Me1P06801 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Me1P06801 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Me1P06801 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Me1P06801 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Me1P06801 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Me1P06801 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Me1P06801 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Me1P06801 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Me1P06801 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Me1P06801 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Me1P06801 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Me1P06801 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Me1P06801 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Me1P06801 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Me1P06801 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Me1P06801 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Me1P06801 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Me1P06801 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Me1P06801 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Me1P06801 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Me1P06801 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Me1P06801 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Me1P06801 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Me1P06801 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Me1P06801 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Me1P06801 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Me1P06801 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Me1P06801 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Me1P06801 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Me1P06801 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Me1P06801 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Me1P06801 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms