Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vmn1r34G3XA52 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms