Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf4E9QAP7 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf4E9QAP7 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf4E9QAP7 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf4E9QAP7 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf4E9QAP7 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf4E9QAP7 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf4E9QAP7 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf4E9QAP7 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf4E9QAP7 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf4E9QAP7 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf4E9QAP7 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf4E9QAP7 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf4E9QAP7 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf4E9QAP7 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf4E9QAP7 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf4E9QAP7 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
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Taf4E9QAP7 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf4E9QAP7 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf4E9QAP7 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf4E9QAP7 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf4E9QAP7 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf4E9QAP7 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf4E9QAP7 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf4E9QAP7 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf4E9QAP7 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf4E9QAP7 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf4E9QAP7 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf4E9QAP7 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf4E9QAP7 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf4E9QAP7 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf4E9QAP7 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf4E9QAP7 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf4E9QAP7 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf4E9QAP7 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf4E9QAP7 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf4E9QAP7 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Taf4E9QAP7 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Taf4E9QAP7 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Taf4E9QAP7 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Taf4E9QAP7 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Taf4E9QAP7 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Taf4E9QAP7 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Taf4E9QAP7 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Taf4E9QAP7 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Taf4E9QAP7 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Taf4E9QAP7 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Taf4E9QAP7 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Taf4E9QAP7 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Taf4E9QAP7 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Taf4E9QAP7 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Taf4E9QAP7 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Taf4E9QAP7 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Taf4E9QAP7 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Taf4E9QAP7 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Taf4E9QAP7 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Taf4E9QAP7 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Taf4E9QAP7 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Taf4E9QAP7 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Taf4E9QAP7 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Taf4E9QAP7 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Taf4E9QAP7 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Taf4E9QAP7 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Taf4E9QAP7 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Taf4E9QAP7 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Taf4E9QAP7 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Taf4E9QAP7 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Taf4E9QAP7 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Taf4E9QAP7 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Taf4E9QAP7 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Taf4E9QAP7 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Taf4E9QAP7 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Taf4E9QAP7 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Taf4E9QAP7 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms