Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Gm12676-201ENSMUST00000149078 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Gm46210-201ENSMUST00000218800 577 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Tex46-201ENSMUST00000046647 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Ccm2-203ENSMUST00000109722 1760 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Gm14616-201ENSMUST00000131690 314 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gcn1E9PVA8 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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