Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Rd3lB2RV38 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Rd3lB2RV38 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Rd3lB2RV38 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Rd3lB2RV38 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Rd3lB2RV38 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
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Rd3lB2RV38 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Rd3lB2RV38 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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