Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms