Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tmigd1Q9D7L8 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms