Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

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Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Ccdc7Q9D541 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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