Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms