Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGAP1Q96PV0 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms