Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms