Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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