Protein–RNA interactions for Protein: Q8C735

Lin9, Protein lin-9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin9Q8C735 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lin9Q8C735 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lin9Q8C735 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lin9Q8C735 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lin9Q8C735 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lin9Q8C735 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lin9Q8C735 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lin9Q8C735 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lin9Q8C735 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lin9Q8C735 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lin9Q8C735 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lin9Q8C735 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lin9Q8C735 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lin9Q8C735 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lin9Q8C735 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lin9Q8C735 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lin9Q8C735 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lin9Q8C735 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lin9Q8C735 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lin9Q8C735 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lin9Q8C735 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lin9Q8C735 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms