Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0F9

Prss35, Inactive serine protease 35, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss35Q8C0F9 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prss35Q8C0F9 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms