Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NischQ80TM9 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
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