Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH4

Ccp110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccp110Q7TSH4 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms