Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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