Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDI5

Ecm29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,840 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm29Q6PDI5 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ecm29Q6PDI5 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ecm29Q6PDI5 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Ecm29Q6PDI5 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ecm29Q6PDI5 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Ecm29Q6PDI5 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Ecm29Q6PDI5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ecm29Q6PDI5 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ecm29Q6PDI5 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ecm29Q6PDI5 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ecm29Q6PDI5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ecm29Q6PDI5 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Ecm29Q6PDI5 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ecm29Q6PDI5 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ecm29Q6PDI5 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ecm29Q6PDI5 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ecm29Q6PDI5 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ecm29Q6PDI5 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ecm29Q6PDI5 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ecm29Q6PDI5 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ecm29Q6PDI5 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ecm29Q6PDI5 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ecm29Q6PDI5 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ecm29Q6PDI5 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ecm29Q6PDI5 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ecm29Q6PDI5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ecm29Q6PDI5 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ecm29Q6PDI5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Ecm29Q6PDI5 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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