Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Pkp4Q68FH0 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
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Pkp4Q68FH0 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Pkp4Q68FH0 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Pkp4Q68FH0 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Pkp4Q68FH0 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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Pkp4Q68FH0 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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Pkp4Q68FH0 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Pkp4Q68FH0 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Pkp4Q68FH0 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Pkp4Q68FH0 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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