Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnna3Q65CL1 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms