Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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PcolceQ61398 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
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PcolceQ61398 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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PcolceQ61398 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
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PcolceQ61398 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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