Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.5 ms