Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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