Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Rpusd2Q149F1 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Rpusd2Q149F1 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Rpusd2Q149F1 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Rpusd2Q149F1 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rpusd2Q149F1 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rpusd2Q149F1 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rpusd2Q149F1 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rpusd2Q149F1 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rpusd2Q149F1 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rpusd2Q149F1 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rpusd2Q149F1 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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