Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Traf3ip1Q149C2 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf3ip1Q149C2 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf3ip1Q149C2 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf3ip1Q149C2 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Traf3ip1Q149C2 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf3ip1Q149C2 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf3ip1Q149C2 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf3ip1Q149C2 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf3ip1Q149C2 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf3ip1Q149C2 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf3ip1Q149C2 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Traf3ip1Q149C2 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Traf3ip1Q149C2 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Traf3ip1Q149C2 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Traf3ip1Q149C2 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Traf3ip1Q149C2 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Traf3ip1Q149C2 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Traf3ip1Q149C2 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Traf3ip1Q149C2 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf3ip1Q149C2 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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