Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

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Length 693 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Tgm3Q08189 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Tgm3Q08189 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Tgm3Q08189 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Tgm3Q08189 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Tgm3Q08189 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Tgm3Q08189 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Tgm3Q08189 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tgm3Q08189 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Tgm3Q08189 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Tgm3Q08189 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tgm3Q08189 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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Tgm3Q08189 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tgm3Q08189 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tgm3Q08189 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tgm3Q08189 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tgm3Q08189 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tgm3Q08189 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tgm3Q08189 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tgm3Q08189 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tgm3Q08189 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tgm3Q08189 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tgm3Q08189 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tgm3Q08189 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tgm3Q08189 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tgm3Q08189 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tgm3Q08189 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tgm3Q08189 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tgm3Q08189 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tgm3Q08189 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tgm3Q08189 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tgm3Q08189 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tgm3Q08189 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tgm3Q08189 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tgm3Q08189 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tgm3Q08189 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tgm3Q08189 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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