Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms