Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms