Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms