Protein–RNA interactions for Protein: P49935

Ctsh, Pro-cathepsin H, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtshP49935 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtshP49935 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtshP49935 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtshP49935 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtshP49935 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtshP49935 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtshP49935 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CtshP49935 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtshP49935 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtshP49935 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CtshP49935 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CtshP49935 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CtshP49935 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtshP49935 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtshP49935 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtshP49935 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtshP49935 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtshP49935 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtshP49935 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CtshP49935 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtshP49935 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtshP49935 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtshP49935 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtshP49935 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtshP49935 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtshP49935 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtshP49935 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtshP49935 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtshP49935 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtshP49935 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtshP49935 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtshP49935 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtshP49935 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtshP49935 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtshP49935 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtshP49935 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtshP49935 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtshP49935 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtshP49935 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtshP49935 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtshP49935 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtshP49935 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtshP49935 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtshP49935 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtshP49935 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtshP49935 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtshP49935 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtshP49935 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CtshP49935 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtshP49935 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CtshP49935 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CtshP49935 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CtshP49935 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CtshP49935 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtshP49935 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CtshP49935 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtshP49935 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtshP49935 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtshP49935 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtshP49935 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtshP49935 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtshP49935 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtshP49935 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtshP49935 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtshP49935 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtshP49935 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtshP49935 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtshP49935 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtshP49935 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtshP49935 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtshP49935 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtshP49935 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtshP49935 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtshP49935 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtshP49935 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CtshP49935 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtshP49935 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CtshP49935 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtshP49935 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtshP49935 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtshP49935 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CtshP49935 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtshP49935 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtshP49935 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtshP49935 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtshP49935 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtshP49935 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtshP49935 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtshP49935 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtshP49935 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtshP49935 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtshP49935 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtshP49935 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtshP49935 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtshP49935 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtshP49935 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CtshP49935 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtshP49935 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtshP49935 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtshP49935 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms