Protein–RNA interactions for Protein: P40124

Cap1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cap1P40124 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cap1P40124 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cap1P40124 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cap1P40124 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cap1P40124 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cap1P40124 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cap1P40124 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms