Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CftrP26361 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CftrP26361 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CftrP26361 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CftrP26361 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CftrP26361 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CftrP26361 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CftrP26361 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CftrP26361 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CftrP26361 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CftrP26361 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CftrP26361 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CftrP26361 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CftrP26361 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CftrP26361 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CftrP26361 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CftrP26361 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CftrP26361 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CftrP26361 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CftrP26361 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CftrP26361 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CftrP26361 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CftrP26361 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CftrP26361 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CftrP26361 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CftrP26361 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CftrP26361 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CftrP26361 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CftrP26361 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CftrP26361 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CftrP26361 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CftrP26361 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CftrP26361 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CftrP26361 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CftrP26361 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CftrP26361 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CftrP26361 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CftrP26361 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CftrP26361 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CftrP26361 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CftrP26361 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CftrP26361 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CftrP26361 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CftrP26361 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CftrP26361 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CftrP26361 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CftrP26361 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CftrP26361 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CftrP26361 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CftrP26361 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CftrP26361 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CftrP26361 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CftrP26361 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CftrP26361 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CftrP26361 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CftrP26361 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CftrP26361 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CftrP26361 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CftrP26361 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CftrP26361 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CftrP26361 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CftrP26361 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CftrP26361 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CftrP26361 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CftrP26361 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CftrP26361 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CftrP26361 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CftrP26361 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CftrP26361 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CftrP26361 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CftrP26361 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CftrP26361 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CftrP26361 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CftrP26361 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CftrP26361 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CftrP26361 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CftrP26361 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CftrP26361 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CftrP26361 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CftrP26361 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CftrP26361 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CftrP26361 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CftrP26361 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CftrP26361 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CftrP26361 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CftrP26361 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CftrP26361 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CftrP26361 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CftrP26361 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CftrP26361 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CftrP26361 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CftrP26361 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CftrP26361 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CftrP26361 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CftrP26361 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CftrP26361 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CftrP26361 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CftrP26361 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CftrP26361 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CftrP26361 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms