Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms