Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

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Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18528 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18528 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18528 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18528 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18528 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18528 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18528 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18528 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18528 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18528 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18528 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18528 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18528 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18528 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18528 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18528 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18528 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18528 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18528 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18528 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18528 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18528 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18528 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18528 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P18528 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P18528 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18528 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18528 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P18528 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18528 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18528 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18528 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18528 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18528 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18528 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18528 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18528 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18528 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18528 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18528 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18528 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18528 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P18528 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18528 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18528 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18528 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18528 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18528 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18528 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18528 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18528 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18528 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18528 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18528 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18528 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18528 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18528 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18528 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18528 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18528 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18528 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18528 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
P18528 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18528 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18528 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18528 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18528 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18528 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18528 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18528 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18528 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
P18528 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18528 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18528 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18528 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18528 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18528 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18528 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18528 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18528 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18528 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18528 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18528 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
P18528 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18528 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18528 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18528 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18528 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18528 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18528 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18528 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18528 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18528 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18528 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18528 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18528 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P18528 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18528 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18528 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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