Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms