Protein–RNA interactions for Protein: P16330

Cnp, 2',3'-cyclic-nucleotide 3'-phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnpP16330 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CnpP16330 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CnpP16330 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CnpP16330 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CnpP16330 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CnpP16330 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CnpP16330 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CnpP16330 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CnpP16330 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CnpP16330 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CnpP16330 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CnpP16330 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CnpP16330 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CnpP16330 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CnpP16330 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CnpP16330 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CnpP16330 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CnpP16330 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CnpP16330 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CnpP16330 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CnpP16330 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CnpP16330 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CnpP16330 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CnpP16330 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CnpP16330 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CnpP16330 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CnpP16330 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CnpP16330 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CnpP16330 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CnpP16330 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CnpP16330 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CnpP16330 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CnpP16330 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CnpP16330 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CnpP16330 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CnpP16330 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CnpP16330 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CnpP16330 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CnpP16330 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CnpP16330 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CnpP16330 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CnpP16330 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CnpP16330 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CnpP16330 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CnpP16330 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CnpP16330 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CnpP16330 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CnpP16330 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CnpP16330 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CnpP16330 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CnpP16330 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CnpP16330 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CnpP16330 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CnpP16330 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CnpP16330 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CnpP16330 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CnpP16330 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CnpP16330 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CnpP16330 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CnpP16330 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CnpP16330 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CnpP16330 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CnpP16330 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CnpP16330 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CnpP16330 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CnpP16330 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CnpP16330 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CnpP16330 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CnpP16330 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CnpP16330 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CnpP16330 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CnpP16330 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CnpP16330 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CnpP16330 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CnpP16330 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CnpP16330 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CnpP16330 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CnpP16330 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CnpP16330 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CnpP16330 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CnpP16330 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CnpP16330 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CnpP16330 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CnpP16330 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CnpP16330 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CnpP16330 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CnpP16330 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CnpP16330 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CnpP16330 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CnpP16330 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CnpP16330 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CnpP16330 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CnpP16330 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CnpP16330 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CnpP16330 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CnpP16330 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CnpP16330 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CnpP16330 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CnpP16330 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CnpP16330 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms