Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms