Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Copb2O55029 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Copb2O55029 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Copb2O55029 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Copb2O55029 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Copb2O55029 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Copb2O55029 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms